金識原(GenseqPM)感染病原高通量檢測

金匙醫學案例追蹤十五:惡性腫瘤化療后混合感染,mNGS高效辨真兇!

【概要描述】本例患者因惡性淋巴瘤進行了為期4周的化療,患者免疫功能明顯減低,除肺孢子菌感染外也易合并其他病原體,患者使用mNGS檢測在短期內發現肺孢子菌合并肺炎鏈球菌的感染,及時使用了對應的抗生素進行治療,做到了早期發現、早期治療,結果表明mNGS尤其適用于免疫力低下,缺陷的患者,因為他們更容易發生正常人中罕見的病原體感染。

金匙醫學案例追蹤十五:惡性腫瘤化療后混合感染,mNGS高效辨真兇!

【概要描述】本例患者因惡性淋巴瘤進行了為期4周的化療,患者免疫功能明顯減低,除肺孢子菌感染外也易合并其他病原體,患者使用mNGS檢測在短期內發現肺孢子菌合并肺炎鏈球菌的感染,及時使用了對應的抗生素進行治療,做到了早期發現、早期治療,結果表明mNGS尤其適用于免疫力低下,缺陷的患者,因為他們更容易發生正常人中罕見的病原體感染。

詳情

  

 

  病史及主訴

 

  患者女性,65歲

 

  主訴:惡性淋巴瘤5月+,4 周期 R-CHOP 化療后

 

  現病史:患者2019年11月無明顯誘因出現燒心、進食阻擋感

 

  既往史:平素身體健康,否認高血壓、否認糖尿病、否認冠心病,否認肝炎、結核等傳染病史,2020年1月因貧血給予蔗糖鐵,輸注同型紅細胞治療。

 

  體格檢查:T:35.7℃,P:76次/分 R:18次/分 BP:92/56mmHg

 

  肺部CT結果:

 

  1.雙肺彌漫性磨玻璃密度,較前顯著,不排除淋巴瘤浸潤可能;雙肺間質性改變;右肺上葉后段結節及斑片,部分較前新發,左肺下葉病變較前有所吸收;右肺中葉鈣化灶。

 

  2.原診胃淋巴瘤治療后,胃底賁門部病灶較前邊界清晰,體積略見效,胃底部結節樣增厚,厚度較前增大,膽囊結石,較前新發。

 

  入院診斷

 

  1.彌漫性B細胞淋巴瘤(胃彌漫大B細胞淋巴瘤侵犯食管及腹腔淋巴結 IV B期)

 

  2.貧血

 

  入院后行支氣管鏡檢查,同時肺泡灌洗液送檢金匙醫學進行高通量測序檢查:一天后回報肺炎鏈球菌特異性序列28條,耶氏肺孢子菌12條。

 

 

  后續治療與結果

 

  根據mNGS結果,治療方案改為口服復方新諾明 2片/次 2次/日,莫西沙星 0.4g/次 1次/日,經治療后患者偶有咳嗽,無胸悶,憋氣,無發熱,進食睡眠恢復,予以出院,腫瘤科門診隨訪。

 

  治療體會

 

  本例患者因惡性淋巴瘤進行了為期4周的化療,患者免疫功能明顯減低,除肺孢子菌感染外也易合并其他病原體,患者使用mNGS檢測在短期內發現肺孢子菌合并肺炎鏈球菌的感染,及時使用了對應的抗生素進行治療,做到了早期發現、早期治療,結果表明mNGS尤其適用于免疫力低下,缺陷的患者,因為他們更容易發生正常人中罕見的病原體感染。

 

  知識小課堂:

 

  肺孢子菌肺炎(Pneumocystis pneumonia,PCP)是由耶氏肺孢子菌(Pneumocystis jiroveci)引起的一種機會性感染,常見于人類免疫缺陷病毒(HIV)感染的患者。在非HIV感染者中,PCP一般發病更急,病情更嚴重,病死率大大高于HIV陽性的患者。臨床研究表明,HIV感染者合并PCP病死率為10%~20%,而非HIV患者合并PCP病死率為30%~60%,其中,惡性腫瘤合并PCP患者死亡風險又高于其他病因的患者。隨著腫瘤治療技術的進步,更多更積極的治療方法、新的抗腫瘤和免疫抑制藥物的出現,腫瘤患者并發 PCP 的風險變得更高,而淋巴細胞減少、 長期住院治療、放療和強化化療是惡性腫瘤合并 PCP 的危險因素,一項回顧性研究結果顯示,103 例 HIV陰性的 PCP 患者中,實體腫瘤患者為 17.5% ,69%的患者曾接受細胞毒藥物,55% 曾接受較長期糖皮質激素治療,38% 患者死于 PCP。參考文獻:1.葉寧, 朱明利, 李茜茜,等. 肺孢子菌肺炎實驗室診斷研究進展[J]. 中國衛生檢驗雜志, 2017, 027(004):604-605,608.2.盧思奇. 肺孢子菌肺炎的病原檢查和基因檢測[J]. 診斷學理論與實踐, 2010, 009(006):552-554.3.YiZ , Jing-Wen A , Peng C , et al. A cluster of cases of pneumocystis pneumoniaidentified by shotgun metagenomics approach[J]. Journal of Infection,2018:S0163445318302585-.

 

關于金匙醫學

 

  “金匙Genskey”取“基因鑰匙”的含義,寓意企業以基因科技作為破解感染診斷難題的金鑰匙。金匙醫學研發中心坐落于北京中關村昌平生命科學園,是中關村高新企業,第三方醫學檢驗所分別位于天津、上海,另在天津建有GMP車間,生產病原診斷醫療器械。金匙醫學的核心技術是感染病原高通量檢測技術,為廣大醫療工作者提供全面、準確、快速的病原微生物檢測產品及服務。金匙醫學已獲得數個I類,II類注冊證,2項已授權發明專利,二十余項計算機軟著。

 

  金匙醫學與中日友好醫院、北京大學人民醫院、四川大學華西醫院等頂級醫學院所建立了深入合作關系,面向呼吸、血液、重癥、檢驗等科室,提供病原微生物宏基因組診斷產品及檢測服務的整體解決方案。

 

  在新型冠狀病毒疫情期間,金匙醫學聯合四川大學華西醫院開展SARS-Cov-2變異分析研究,并在國際病毒學權威雜志Journal of Virology發表合作研究論文。同時,金匙醫學開發的“新型冠狀病毒(2019-nCoV)IgM/IgG抗體檢測試劑盒(膠體金法)”、“新型冠狀病毒(2019-nCoV)核酸檢測試劑盒(熒光PCR法)”和“新型冠狀病毒(2019-nCoV)核酸檢測試劑盒(可逆末端終止法)”均已經取得CE準入資格。金匙醫學共計四個產品通過CE認證,分別涵蓋二代測序、PCR、膠體金三種技術平臺,滿足各種臨床檢測和科研需求,為全球疫情防控貢獻重要力量。

 

 

 

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