金識原(GenseqPM)感染病原高通量檢測

金匙醫學案例追蹤十一:”纏斗千年”的結核分枝桿菌

  • 分類:診斷案例
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  • 來源:
  • 發布時間:2020-04-18 15:35
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【概要描述】 金識原??從一69歲男性患者肺泡灌洗液中檢出結核分枝桿菌(Mycobacterium tuberculosis)特異性序列10條,疑與臨床患者肺部感染有關。

金匙醫學案例追蹤十一:”纏斗千年”的結核分枝桿菌

【概要描述】 金識原??從一69歲男性患者肺泡灌洗液中檢出結核分枝桿菌(Mycobacterium tuberculosis)特異性序列10條,疑與臨床患者肺部感染有關。

  • 分類:診斷案例
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  金識原??從一69歲男性患者肺泡灌洗液中檢出結核分枝桿菌(Mycobacterium tuberculosis)特異性序列10條,疑與臨床患者肺部感染有關。

 

  圖:結核分枝桿菌基因組覆蓋圖

 

  “不死不滅的肺癆”

 

  1882年3月24日,德國細菌學家科赫(Robert Koch,1843-1910)宣布他發現了導致結核病的病原體,彼時的結核分枝桿菌被命名為Tuberkelvirus,次年才正式更名為結核分枝桿菌。分離的第一株菌株至今仍收藏在英國皇家科學院,而3月24日也被命名為“世界防治結核病日”。

 

  結核病,又稱為“肺癆”,對于人類來說既陌生又熟悉,魯迅,肖邦,林徽因,雪萊這些名人一度讓結核病名聲在外,根據中國疾控中心的數據,中國每年結核病的發病人數在86萬左右,是當下國內“談疫色變”COVID-19確診人數的十倍左右。

 

  病原特點

 

  結核分枝桿菌,菌體細長,稍彎曲,兩端鈍圓,大小為(0.2-0.5)um。革蘭染色不易著色,抗酸染色呈紅色。以痰液直接涂片,結核分枝桿菌多為單個存在,有時呈現V、Y、人字形排列,痰液菌量多時可排列為束狀或者集聚成團。

 

  圖結核分枝桿菌純培養的鏡下形態(抗酸染色)以及痰標本直接涂片(抗酸染色)

 

  結核分枝桿菌具有超強的感染能力,患者咳嗽,打噴嚏,大聲說話,其中包含細菌的微小液滴也會隨之噴出,附著在空氣中的懸浮顆粒中生存數小時,或隨著呼吸道飛沫被他人吸入。結核分枝桿菌感染最主要的特點是“欺軟怕硬”。當人體的免疫力強的時候,那它自動進入休眠狀態,潛伏以待時機;當人體免疫力下降的時候,病原就會擴散至其他的人體器官。據保守估計,目前全球的結核潛伏感染者高達25%,活動性的結核患者或許僅僅是感染患者的“冰山一角”。

 

  主要臨床癥狀

 

  人對結核分枝桿菌具有較高的易感性,臨床主要以病原菌通過飛沫傳播進入呼吸道引起的肺結核最為常見:肺結核臨床主要癥狀為連續咳嗽、咳痰2周以上,或痰中帶有血絲。同時還可能伴有胸痛、盜汗、午后低熱、全身疲乏、食欲減退等其他常見的癥狀。

 

  此外,部分患者結核分枝桿菌可進入血液循環引起肺內、外播散,如腦、腎結核,痰菌被嚥入消化道也可引起腸結核、結核性腹膜炎等。

 

  臨床診斷“金標準”

 

  分枝桿菌的培養以及鑒定是診斷的“金標準”,但是結核分枝桿菌生長及其緩慢(其最快分裂增殖速度為18小時一代,作為對比,大腸桿菌約需20分鐘便可繁殖一代),一般需要2-4周才能有結果,這也導致臨床難以對患者進行快速精準的診療。

 

  mNGS輔助臨床快速精準診斷

 

  2019年9月3日,南方醫科大學南方醫院胡亞芳教授和北京協和醫院關鴻志教授團隊聯合在《Frontiers in Microbiology》(IF:4.259)上發表了關于mNGS在結核性腦膜炎病原學鑒定中的可行性研究成果,該研究結果為致殘致死率高但早期診斷困難的結核性腦膜炎提供了一種新的診療方向與方法。

 

表:目前結核性腦膜炎不同檢測方法對比

 

  研究顯示傳統的方法診斷結核性腦膜炎的陽性率低于40%,且目前很多的治療沒有病原學依據。mNGS憑借其高敏感性、無偏移性、廣覆蓋、高效率的特點為臨床疑難危重、特殊感染、混合感染患者的病原鑒定提供了一種新的診療思路,促進感染性疾病的精準診療。

 

 參考文獻:

 

  1. 周庭銀主編.臨床微生物學診斷與圖解:上海科學技術出版社,2012.05:157-161.
  2. Wang S, Chen Y, Wang D, Wu Y,Zhao D, Zhang J, XieH, Gong Y, Sun R, Nie X, Jiang H, Zhang J, Li W, Liu G, Li X, Huang K, Huang Y,Li Y, Guan H, Pan S and Hu Y (2019) The Feasibility of MetagenomicNext-Generation Sequencing to Identify Pathogens Causing Tuberculous Meningitisin Cerebrospinal Fluid. Front. Microbiol. 10:1993.

 

 

  關于金匙醫學

 

  “金匙Genskey”取“基因鑰匙”的含義,寓意企業以基因科技作為破解感染診斷難題的金鑰匙。金匙醫學研發中心坐落于北京中關村昌平生命科學園,是中關村高新企業,第三方醫學檢驗所分別位于天津、上海,另在天津建有GMP車間,生產病原診斷醫療器械。金匙醫學的核心技術是感染病原高通量檢測技術,為廣大醫療工作者提供全面、準確、快速的病原微生物檢測產品及服務。金匙醫學已獲得數個I類,II類注冊證,2項已授權發明專利,二十余項計算機軟著。

 

  金匙醫學與中日友好醫院、北京大學人民醫院、四川大學華西醫院等頂級醫學院所建立了深入合作關系,面向呼吸、血液、重癥、感染、檢驗等科室,提供病原微生物宏基因組診斷產品及檢測服務的整體解決方案。

 

 

 

 

 

 

 

 

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