金識原(GenseqPM)感染病原高通量檢測

金匙醫學案例追蹤三:揪出不明原因重癥腦炎的“罪魁禍首”!

  • 分類:診斷案例
  • 作者:小徐
  • 來源:
  • 發布時間:2020-03-28 07:53
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【概要描述】金識原??從一位27歲女性的腦脊液樣本中檢出偽狂犬病毒/豬皰疹病毒1型(Pseudorabies Virus,PRV),檢出序列數64條,基因覆蓋度4.9%。

金匙醫學案例追蹤三:揪出不明原因重癥腦炎的“罪魁禍首”!

【概要描述】金識原??從一位27歲女性的腦脊液樣本中檢出偽狂犬病毒/豬皰疹病毒1型(Pseudorabies Virus,PRV),檢出序列數64條,基因覆蓋度4.9%。

  • 分類:診斷案例
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  • 發布時間:2020-03-28 07:53
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金識原??從一位27歲女性的腦脊液樣本中檢出偽狂犬病毒/豬皰疹病毒1型(Pseudorabies Virus,PRV),檢出序列數64條,基因覆蓋度4.9%。

圖示:核酸序列在偽狂犬病毒基因組上的位置

由“犬”病毒引起的病毒病

偽狂犬病毒又稱豬皰疹病毒I型,為雙鏈DNA病毒,屬于皰疹病毒科中的a皰疹病毒亞科[1]。同樣屬于a皰疹病毒亞科單純皰疹病毒I、II和水痘帶狀皰疹病毒是人類神經系統病毒感染的重要病原。而豬是PRV主要自然宿主和傳染來源[2],PRV對豬具有嗜神經性,可由神經突觸后向突觸前神經元逆行侵染神經系統。由于臨床癥狀類似狂犬病得名偽狂犬病。

偽狂犬病病毒粒子呈橢圓形或圓形,其基因組為線性dsDNA分子,分子量為87×106 (約150kb),(G+C)mol%含量為73%,二十面體立體對稱。位于細胞核內無包膜的病毒粒子直徑約110~150nm,位于細胞質內帶包膜的成熟病毒粒子的直徑約150~180nm。包膜表面有呈放射狀排列的刺突,其長度約8~10nm。

 

偽狂犬病毒腦炎

PRV對人類的致病性正逐步被研究所確認。1987年Mravak等報道三例血清抗體陽性的疑似PRV感染病例,三位患者來自于歐洲不同的地區,在密切接觸貓后出現1-3周的前驅癥狀,繼而出現自限性的多顱神經受累的表現,沒有典型的腦炎癥狀,也未采用病毒核酸檢測證實,單純血清學陽性不排除為既往感染或者較差反應。而近期華山醫院、西京醫院等團隊也應用NGS的方法揭示了PRV對人的致病性。華山醫院感染科張文宏團隊發現了PRV引起眼內炎的病例,并應用NGS技術在患者的玻璃體液中檢測到了PRV,并通過PCR和血清學檢測證實[3]
 
偽狂犬病毒腦炎(Pseudorabies encephalitis, PRE)臨床特點
1、患者主要為從事生豬與生豬肉生產、加工與銷售的人員;
2、急性起病,病前數日可有發熱、頭痛和感冒樣癥狀的前驅期;
3、以迅速進展的重癥腦炎多見,表現為癲癇發作,意識障礙,常需要ICU救治,甚至呼吸機輔助呼吸;
4、其他系統受累:視網膜炎等。
 
 
偽狂犬病毒腦炎(Pseudorabies encephalitis, PRE)的神經學影像表現為大腦灰質受累為主的壞死性腦炎,受累部位包括邊緣系統、基底節區與腦干。
 
mNGS助力快速確診偽狂犬病毒感染
由于偽狂犬病毒腦炎臨床以重癥腦炎多見,且一般為急性起病,因而患者早期快速確診極為重要。2019年趙偉麗[4]等在《中華醫學雜志》發表“偽狂犬病毒腦炎臨床觀察與腦脊液二代測序鑒定”的臨床研究。該研究提示偽狂犬病毒是人類腦炎的病因之一。對于不明原因的腦炎病例,如果流行病學、臨床表現、腦脊液以及影像學符合PRE,應盡快完善PRE核酸檢測以及血清學檢測。腦脊液mNGS有助于從不明病因腦炎中篩查PRV等新發病毒腦炎。

 

參考文獻:

1.Pomeranz L E , Reynolds A E , Hengartner C J .Molecular biology of pseudorabies virus: impact on neurovirology and veterinarymedicine.[J]. Microbiology & Molecular Biology Reviews Mmbr, 2005, 69(3):462.
2. 黃駿明,朱慶虎. 豬偽狂犬病流行情況調查[J]. 中國預防獸醫學報,1996(4): :33-35.
3.Ai JW, Weng SS, Cheng Q, et al., HumanEndophthalmitis caused by Pseudorabies Virus Infection [J]. Emerg Infec Dis,2018.
4. 趙偉麗, 烏依罕, 李紅芳, 等. 偽狂犬病毒腦炎臨床觀察與腦脊液二代測序鑒定 [J] . 中華醫學雜志, 2018, 98( 15 ): 1152-1157.

 

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“金匙Genskey”取“基因鑰匙”的含義,寓意企業以基因科技作為破解感染診斷難題的金鑰匙。金匙醫學研發中心坐落于北京中關村昌平生命科學園,是中關村高新企業,第三方醫學檢驗所分別位于天津、上海,另在天津建有GMP車間,生產病原診斷醫療器械。金匙醫學的核心技術是感染病原高通量檢測技術,為廣大醫療工作者提供全面、準確、快速的病原微生物檢測產品及服務。

金匙醫學與中日友好醫院、北京大學人民醫院、四川大學華西醫院等頂級醫院建立了深入合作關系,面向呼吸、血液、檢驗等科室,提供病原微生物宏基因組診斷產品及檢測服務的整體解決方案。

 

 

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